面對百年巨災，農民長期賴以維生的耕地，隨著無情的風雨而流失，居民頓時喪失重要的生計來源，為能協助居民進行農業復建，政府推動「農地回填」政策，配合河川清疏作業進行，於堤防興建後，背填疏濬土砂固堤，讓河川清疏（水利）、堤防加固及農地回填（農業）能夠結合順利進行，解決了農民農地流失無法復耕的問題，也為莫拉克風災重建創新的作為之一。

行政院重建會表示，莫拉克颱風「農地回填」復建工程，政府共投入17.77億元之復建經費，並逐步完成了南投、台南、屏東及臺東四縣市492公頃之農地填復，本項工作因涉及水利、農業、地政與工程各項作業，其更顯複雜與艱鉅，為能積極解決問題，於98年10月7日第11次工作小組決議，於堤防或護岸等之復建或新建工程時一併逕以河疏濬土石填復，不計收土石價款，來加速完成農地回填作業，解決砂石回填法令限制問題。並強調在四年內行政院重建會召開近80場會議，各部會更發揮了團隊合作的精神，處理一項又一項的挑戰與工作，以達保全重建區居民生命財產安全並盡速恢復產能之目標。

行政院重建會進一步表示，從100年3月起，各地農地回填之工作陸續交耕，看到曾經消失的農地，一點一滴的被復建，就像拼回一片一片的拼圖，並看見農民回到熟悉的土地上，再度拿起農具，辛勤耕種，阡陌良田的景象重現，絕對是最動人的一幅圖畫。在此專書的訪談過程中，臺南市善化區的蘇清富農民曾感性的說：「當時農地流失達兩層樓高，真的不知自己的田在哪裡、路在哪裡！想不到有一天我還可以在這裡繼續耕作」。

「重建流失的拼圖－農地回填」專書記錄各部會與縣市政府辦理農地回填各項工作外，並透過訪談瞭解執行單位的團隊合作精神，並記錄重建區農民從災後農地流失而沮喪、慢慢看到農地逐步回填的期待到重新復耕而喜悅的心路歷程。
 

太麻里重劃區農地回填復耕情形

台南善化區農地回填復耕情形

重建流失的拼圖-農地回填專書