臺南縣長蘇煥智本（12）月1日表示莫拉克颱風災後復建工程核定速度遲緩，本會澄清如下：

　　本次莫拉克颱風降雨量前所未見，於全台各地均造成嚴重災情，政府為儘速完成重建工作，依據「莫拉克颱風災後重建特別條例」編列特別預算，並成立莫拉克颱風災後重建推動委員會，全力投入重建工作。

　　各主管部會為利復建工程時效，早在風災過後即分別請各地方政府提報復建需求，並積極安排審議會議審查地方政府提報之工作計畫，協助釐清致災原因及提供專業技術之建議，並請各地方政府於特別預算通過前先行辦理招標前置作業，以便於特別預算審議通過後，即可著手辦理工程發包及施作。

　　至於台南縣政府質疑各部會核定速度緩辦1節，經查部會反應有部分工作計畫縣府遲至9月底甚至10月初才提報，各部會依程序需安排會勘及審議，審查所提工作計畫內容，又需待特別預算通過後，始能正式予以核定，各主管機關都已盡最大努力，加速行政流程。如台南縣政府分別於98年9月9日及10月29日提報2批「縣（市）管河川復建工程」計畫共計8.4億元到水利署，水利署隨即展開複勘工作，並於10月13日及11月12日分別召開審議會議，共計核定6.69億元。98年11月10日特別預算經立法院審議通過後，即將第1批核定結果於98年11月20日函覆縣府，第2批核定結果預計於12月初函覆。

　　重建會表示，在如此嚴重的天災下，不論民間或政府、中央或地方，都竭盡心力辦理各項搶災搶險、居民安置、社會救助、災後復建等重建工作，尤其受災縣市政府工作更為繁重，中央各機關在協助地方重建工作上也絕無怠慢。雖時值選舉期間，災後重建應無假期，亦不宜列為政治議題討論，全國各界應齊心齊力，攜手合作，儘速完成災後重建工作。