重建工作工作刻不容緩，以安置災民為優先考量，永久屋之興建為政府安置災民的重要措施，期能給災民一個家，故永久屋基地的選址係尊重居民之意願而選定，且須通盤考量，將各項影響因素納入，以安全為首要，對阿里山鄒族八八風災自救會認為災後部落重建進度緩慢，揚言要封鎖阿里山公路一事，重建會今(23)日表示：嘉義縣阿里山地區於莫拉克颱風期間受創嚴重，受限於山坡地，地質環境特殊，永久屋基地之尋覓相形困難，於開發規劃過程中，須考量水土保持等多項因素；惟目前轆子腳基地也已動工興建，竹崎基地亦將於近日動土，將供災民於8月8日前進住永久屋；自救會所關心之樂野基地及樟樹湖基地經鑽探、地質調查、探勘等各項作業後，在土地開發審查會議中經審查委員以專業評估咸認不宜開發，且無法以工程設計或其他方法解決，基於安全考量，將上開基地列為不宜開發，中央重建會獲知後亦深感遺憾。

災後重建工作以尊重當地居民、部落、文化為主，以離災不離村、離村不離鄉為原則，行政院重建會表示：樟樹湖基地及樂野基地水土保持計畫審議未過，已立即請嘉義縣政府與災民溝通並即啟動尋覓基地或考量以散居方式減緩環境衝擊方式或另尋求替代方案，以儘早安置災區民眾。重建會並於4月23日召開嘉義縣永久屋第六次專案協調會議，會議中亦討論如何積極尋找鄰近合適地點以立即啟動永久屋基地勘查作業；另行政院原住民族委員會亦將於4月27日於嘉義召開嘉義縣阿里山鄉莫拉克颱風災後重建聯繫會報，會議亦將討論永久屋推動工作事宜而重建會陳副執行長振川與來吉村自救會副會長陳有福聯繫，陳副會長表示不會有封路行為，但盼政府能加速永久屋安置作為。