因為莫拉克颱風的影響，造成山區尚有8億立方公尺土石，隨時會因汛期豪雨沖刷而下，造成道路、橋梁、堤防及聚落受損，行政院重建會特於汛期前提早佈署，做好防汛整備，0610連日超大豪雨來襲，重建區並未發生重大災情。

重建會對於防汛整備提早佈署，在4月19日召開第41次工作小組會議時，提出汛期整備工作，針對汛期將至，特別請農委會及經濟部等機關研擬防汛整備對策，並要求5大流域(林邊溪、太麻里溪、曾文溪、濁水溪及高屏溪)主管機關提出防汛宣導工作，以期達到減災、防災及避災效果。行政院重建會執行長陳振川希望中央各單位協助地方政府強化防災整備，尤其部落社區的危險地帶，要檢視公共設施，如擋土牆裂縫、坡地安全滑動變化等情形，提早發現災害並加強對居民作疏散撤離宣導，方能及時防範，以維護生命安全。

陳執行長更於6月5日親自召開5大流域防汛整備檢討會，首先要求公路總局加強監控轄區內重點橋梁，並適時掌握啓動封橋、封路時機；再則，對於流域上游、中游、下游的橋梁及水利構造物等安全也要求加以檢查評估，避免造成防汛缺口。最後並提醒地方政府及公所亦應備妥相關防汛搶修、搶險材料、機具，同時向居民宣導疏散撤離作為，才能順利通過今年汛期考驗。

本次莫拉克重建永久性橋梁及永久屋方面，尚無重大災情傳出，地方幹部均予以肯定，如嘉義縣阿里山鄉長陳明利和多位村長即肯定重建會所督導的工程品質，尤其是已興建完工的道路、擋土牆及新美橋等，經得起豪雨考驗；屏東縣霧台鄉佳暮生活文化關懷協會理事長杜桂美也表示，長治百合部落永久屋這次大雨沒有災情，讓老人心安不少；小林村重建協會理事長蔡松諭更表示重建後的設施確實有派上用場。
 

重建會李政賢處長勘查禮納里部落滯洪池

重建會關心避難安置處所(鳳山區農會茂林辦事處)居民