總統馬英九20日指出，從這次八八水災當中，大家學到非常重要的教訓，「預防重於治療」。對於災難，一定要料敵從寬，禦敵從嚴，做好最壞的打算，做好最嚴密的防範。

馬總統下午在總統府接見衛生署八八水災防救災有功人員，對醫護人員在救災期間表現的勇敢與智慧，表達感謝與肯定。他說，這次八八水災最重要的教訓，就是對於災難，一定要料敵從寬，禦敵從嚴，做好最壞打算，做好最嚴密的防範。

他表示，將來整個防災理念都要重新訂定，不管是機構、法規、訓練、教育、演習，通通要改，要把防災當作最重要的工作。碰到類似八八水災這種情況，根本不能去想救災，而是要在災害發生前，就要有行動，要在災難發生之前，就撤離。

馬總統重申，政府目前採取的策略，就是超前布署、預置兵力，「人不能跟天鬥，撤走最好，三十六計走為上計」。所以政府把人早早遷走，就算有損失，頂多只是財產損失，不會有人命犧牲。「從這個當中，我們也學到了很多教訓」。

由於在場都是衛生醫療人員，馬總統也特別提到H1N1新流感的預防。他強調，在衛生署長楊志良的領導下，台灣的疫情高峰得以往後推，擋不住時，再透過藥物、公衛措施，包括停課等，降低傷害。台灣新流感的死亡率控制在百萬分之一，對照全球防疫，已屬不易的成就。