總統馬英九25日說，未來內政部強化災害防救體系後，國軍將根據全國5個作戰區，當颱風警報發布後，主動預置兵力進駐敏感地區，並結合其他部門，將可能發生的災害減到最小。

馬總統下午主持「莫拉克颱風災後重建工作座談會」，副總統蕭萬長也與會，並邀請多位與災區有地域關係的總統府國策顧問及相關部會副首長等人出席。

總統強調，內政部將來進一步強化災害防救體系後，國軍應根據5個作戰區，與各災區的行政、警察及水保等相關體系結合，一旦颱風警報發布之後，「國軍將採取預置兵力，以預先布置兵力的方式，進駐到敏感地區」。

他表示，將來國軍不要等到有災難的時候才出動，「不但要主動，而且在災害發生之前，就到達敏感地區」。

總統認為，國軍主動預置兵力，是災害防救很重要的改變，希望國軍結合其他部門，把可能發生的災害減低到最小，因為「我們知道像這麼大的天災，沒有辦法用人力來抵抗」。

他指出，颱風與地震最大的不同，是颱風可以預測，儘管預測得不是很準，但把人撤走了，傷亡就能夠減少，未來希望大家用這樣的態度面對災難，相信可將災害減到相當的程度，「這一次我們都學到了很多的教訓，一定要在未來完全用上來」。

總統指出，這次88水災，在8月8、9、10日3天內共降下約8、9個月的雨量，雨量之高可說是歷史上所僅見；而50年前發生了87水災，在87水災的61年前，也就是1898年發生「戊戌水災」，濁水溪氾濫決防，死傷的人數超過400人，時間剛好是8月6、7、8日，是一個歷史的巧合。

出席座談會的國策顧問包括華加志、溫興春、陳義秋、洪玉欽、林健治、涂德錡、陳政寬、黃俊雄、林源朗、江彥霆、陳鎮湘、趙守博等人。