台南縣共有133所中小學在莫拉克風災中受損，雖然大多數仍在進行搶修或復建工作，縣府教育處已確定所有學校將於31日如期開學，不會影響學生受教權。

台南縣政府教育處長王建龍表示，台南縣中小學在這次風災中共有68所淹水、133所出現災損，部分低漥地區學校地下室受損嚴重，教具等設備泡水不計其數，縣府呈報給教育部的災損金額高達新台幣3億元。

王建龍表示，往後將盡量不把低漥地區學校的地下室規劃成教室等空間使用，避免又因水災出現巨大損失；目前各受損學校的災後復建進度都在掌握中，將全部按原訂日期在31日開學，不會延期。