莫拉克颱風造成台灣民眾生命與財產重大損失，大陸海協會首批捐贈的人民幣1.5億元款項，已於9月29日入帳，對大陸方面展現的關懷與愛心，海基會再次表達謝忱。

海基會表示，隨著重建工程陸續展開，經與海協會聯繫，海協會的捐款在9月28日匯入海基會專戶，至於捐款使用項目，將與海協會再做溝通。

海基會副董事長兼祕書長高孔廉1日向立法院內政委員會進行業務報告時也指出，截至9月28日止，大陸各地台商共向海基會匯入34筆、約新台幣1億3822萬餘元，預計匯入金額還有1456萬元。

除了大陸台商之外，截至9月25日止，海協會、大陸相關部門及個人，向海基會承諾捐款折合台幣約7億7200萬餘元，對於大陸方面的捐款與物資協助，高孔廉說，海基會陸續移交主管部會妥善運用，並覆函海協會致謝。