財團法人賑災基金會表示，賑災基金會對社會善心捐款運用，公開透明，各界捐助善款運用情形都會定期上網，歡迎民眾查閱。

中華民國紅十字會處理對日本震災捐款引起爭議，媒體也針對財團法人賑災基金會的捐款運用提出質疑。

賑災基金會表示，民國98年8月8日莫拉克風災，內政部轉入賑災基金會專戶捐款計新台幣41億4599萬9061元，基金會委請台南縣市、高雄縣政府等12個地方政府轉發災民單位賑助金計44億1792萬8968元，莫拉克風災善心捐款已全部用於災民，不足經費2億7192萬9907元，由賑災原有專戶支付。

賑災基金會表示，對各界捐助善款運用情形，都會定期上網，歡迎民眾查閱。網址：www.rel.org.tw。

賑災基金會是在90年10月由內政部籌組成立，創立基金3000萬元，由行政院動支90年度第二預備金支應。

921震災重建基金會在97年7月1日業務結束解散，賑災基金會承接其剩餘財產現金45億3051萬9225.5元，不動產房屋111戶，土地兩筆計值4億2709萬9945元，當國內發生重大天然災害時，依據重大天然災害災民賑助核給要點規定，賑助災民。1000411