88水災台南災民提出合計新台幣 1.1億元國賠要求，經濟部水利署13日晚表示尊重，將全力配合調查，但重申颱風雨量實在太大，曾文水庫已盡力攔蓄洪水，直至有潰堤危險不得不洩洪。

水利署13日晚表示，莫拉克颱風過境，曾文溪下游大內、善化等七鄉鎮發生淹水災情，居民誤解是曾文水庫洩洪造成，昨天台南縣88水災受災戶正式提出總計20件求償約 1.1億元的國賠請求；水利署尊重，並全力配合相關調查。

不過，水利署表示，莫拉克颱風陸上警報發布時，曾文水庫水位僅194.68公尺，蓄水率約 24%；但颱風期間降雨量驚人，水庫上游總進洪量約10億立方公尺，水庫攔蓄4.6億立方公尺。

水利署強調，莫拉克颱風降下前所未有的雨量，曾文水庫已盡力攔蓄洪水降低洪峰量，直至滿庫且有潰堤之虞，才不得不洩洪；目前已提「曾文溪治理工程實施計畫」，編列21億元，盼全面改善曾文溪水患。