近年受到颱風引發大雨洪水影響，導致全省重大橋梁受損，相對的也拖延已經動工改建橋梁進度，公路總局表示，除少數橋梁因施工期受到大雨影響，拖延進度外，四十三橋梁已有三十三座已完工，剩餘改建工程將在年底前逐漸完成。

公路總局表示，九十八至九十九兩年度列為重點辦理的省道老舊受損橋梁改建工作，除台十七線國姓橋、台二十八線竹湖陸橋、台三線里港大橋及台一線新埤大橋等四座橋梁，於今年年初陸續完成單側新建橋梁雙向通車後，另側橋梁受汛期影響略有延後外，其餘四十三座橋梁有三十三座已完工，預計將於年底前完工通車。

公路總局進一步解釋工程延宕的原因，公路總局指出，台十七線國姓橋橋梁基礎開挖深度達二十二公尺，受到凡那比颱風侵襲造成圍堰異常滲水及大量湧水瞬間淹沒整座基礎，嚴重影響工程進度，雖然工程進度努力的追趕下，但是完工時間還是拖延到明年二月二十一日始能完成。

公路總局指出，台二十八線竹湖陸橋於南側舊橋（鐵路段）吊梁拆除作業遭遇凡那比及梅姬颱風致台鐵無法配合夜間停駛吊梁，影響後續作業進度，目前進度預估可在明年一月二十四日完工。台一線上的新埤大橋南下線橋梁及台三線里港大橋因凡那比颱風狹帶超大豪雨，施工便道反復遭沖毀，嚴重影響工程進度，最晚分別可在明年一月十九日及二月二十八日完工。

公路總局表示，執行期間因遭受莫拉克颱風侵襲，造成台二十線建山一橋、建山二橋及台二十一線民生大橋等三座橋梁無法辦理由計畫內移除，改建橋梁由五十座修正為四十七座，經公路總局積極趕工，這些省道老舊受損橋梁除四座橋梁外，將全部於年底前完工通車。