八八水災之後，養殖業受創甚深。行政院農委會指出，重災區復養較慢，約恢復6成，另規劃拓展永安養殖區；原預計民國101年可恢復原本養殖規模的計畫，將可提早1年完成。

八八水災重創屏東養殖重鎮。農委會評估，若不快速重建，年產值逾新台幣32億元的產業與生計將消失，決議大幅提高數種養殖漁業天然災害低利貸款額度；預計101年恢復現有規模，104年倍增。

農委會說，屏東縣林邊、佳冬、枋寮為台灣海水魚養殖重鎮，並是全台石斑的主要生產地，97年養殖面積達766公頃，產量逾1萬1000公噸，產值超過32億元。

漁業署副署長蔡日耀說，重災區的復養比較困難，與水權合法否及債信都有關係，合計林邊、佳冬、枋寮約計500公頃養殖地，目前約復養300多公頃。

他表示，政府已規劃在高雄縣永安鄉打造養殖專區，希望導向以海水養殖為主，減少使用淡水，相關引水系統正在施工中。

他指出，雖然重災區復養較難，但加上打造永安鄉作為石斑、虱目魚等養殖專區，原預計101年恢復原本養殖業規模的計畫，可望提早1年（民國100年）完成。