行政院長吳敦義5日率相關主管赴立法院報告莫拉克颱風災後重建特別預算案時指出，98至101年度共投入新台幣1200億元用於災後重建，其中以經濟發展支出占歲出61.8%居首。

吳敦義上午報告「98至101年度中央政府莫拉克颱風災後重建特別預算案」表示，為有效整合各項重建資源，並加速各項重建工作推動與執行，將重建業務分為4大方案積極進行，包括區域規劃方案、基礎建設方案、家園重建方案與產業重建方案。

吳敦義指出，災後重建特別預算經撤回重編後，在總經費維持不變的情形下，增列與減列經費均為86.83億元，減列項目包括減少災民購屋補助、臨時住宅及租金賑助等；增列項目包括增加水利設施復建工程、公路系統搶修及復建計畫等。

預算調整後，98年度至101年度分別編列災後重建預算356億元、549億元、223億元及72億元，以辦理災害救助、設施重建、家園重建、產業重建及災害預防等各項工作，所需財源全數以舉債支應。

依政事別區分，行政院主計長石素梅表示，特別預算經濟發展支出742.2億元，占歲出61.8%居首；社會福利支出295.8億元，占歲出24.6%；一般政務支出92.9億元，占歲出7.8%；一般補助及其他支出50億元，占歲出4.2%；教育科學文化支出19.1億元，占歲出1.6%。

預算依機關別區分，特別預算中以農業委員會主管編列268.5億元最多，主要項目包括專案農業貸款延展、水土保持防災等項目；其次為經濟部主管編列229.8億元，項目包括中央管河川復建工程等項目；交通部主管編列225.6億元，項目包括公路系統搶修及復建計畫等項目。