行政院長劉兆玄8月26日起進駐高雄縣旗山鎮的陸軍第八軍團的「行政院莫拉克颱風災後重建推動委員會」南部辦公室11天，6日完成階段性任務返回台北，後續內閣改組受關注。

重建推動委員會執行長、行政院政務委員蔡勳雄於南部辦公室舉行記者會表示，重建推動委員會8月15日成立後，經7次工作會議、4次專案會議與座談，明天開始將進入重建工作，包括以國土保育為上位的區域計畫與家園重建等。

他說，劉兆玄指示3週內要完成受災地區的安全鑑定，屆時遷建社區就可定案。產業重建部分則包括輔導受災地區中小企業、回復觀光事業與推動基礎建設，即復建重要交通設施、維生設施與水利防洪設施。

行政院研究發展考核委員會主任委員江宜樺表示，截至目前統計，死亡失蹤重傷慰助金可發放576人，已發放527人，發放比例93.4%；住屋毀損不堪居住的安遷救助金，截止昨晚共有1263戶，已發放1177戶，發放比例93.19%。

他說，淹水救助金中央政府已100%撥給縣市政府，縣市政府發放到鄉鎮市公所96%，鄉鎮市公所已發給災民78%。

災民收容與安置部分，江宜樺表示，截至昨晚統計，只有396人仍住在11處臨時收容處所，4445人已轉到18處營區，比例達90%以上；災民申請自行購屋者0人，希望政府補貼租金租屋共583戶，已核定118戶。

經濟部長尹啟銘表示，邀民間參與興建永久屋，目前計有7個安置超過100戶以上的大型重建區。

他說，農田漂流木有46.7萬噸，已清理21.3萬噸，其餘20日前清理完畢；漁港漂流木已清除完竣，水庫漂流木1萬1400萬噸，已清理8300噸，9月底前清除完竣。

尹啟銘表示，河川漂流木除高屏溪，要清除1萬7000噸，已清理1萬噸，其餘10月底前清除；高屏溪流域漂流木情形較嚴重，9月底前清除會有安全顧慮與必須要處理的部分。

河川疏濬部分，他說，這屬於復建工作，會在枯水期完成，經濟部水利署已有新台幣208億元預算、行政院農業委員會水土保持局有91.62億元，農委會林務局有33.66億元。