國防部1日在行政院防災整備會議中表示，未來颱風警報發布，國軍將先進駐警戒區待命，其餘國軍完成編組，第一應變隊在災害發生10分鐘內出發，第二應變隊在3個小時內出發。

國防部次長黃奕炳表示，國軍在88水災後進行檢討，未來協助防災、救災有變革，首先是派駐中央災害應變中心人員的位階將提升，並增派幕僚人員，執行協調部會、機具和人員派遣及新聞發布等任務。

黃奕炳表示，當中央災害應變中心提升到一級開設時，國防部也將同步開設，對各作戰區情況進行回報；各縣市災害應變中心原有的國軍連絡官的軍階，也將提升到中校以上，各鄉鎮市公所也會有國軍連絡人，颱風時各負責人員直接向縣市政府或鄉鎮市公所災害應變中心報到。

他指出，國軍參與災害防救，將依作戰區劃分，依類別和各縣市地區的特性，統一運籌專用部隊，而且在防救的重點工作在「預置兵力」，規劃預置兵力數約有6000人以上。

各區預置兵力方面，黃奕炳表示，花東將預置約400 人，發電機、抽水機等共57部；北部地區預置兵力約3000人，中型輪車、兩棲突擊車、橡皮艇等共90部；南部地區預置兵力約2000人，抽水機、挖土機、中型輪車等共168部；中部地區預置約1700人，各式機具共38部；澎湖、馬祖和金門等外島也有相關措施。

國防部表示，其餘國軍可以運用的兵力，也將編組成第一應變隊和第二應變隊，應變隊在災害發生後，立即出發進行搶救任務，第一應變隊在災後10分鐘內出發，第二應變隊在災後3小時內出發。

國防部指出，軍方調查各縣市閒置軍營和可用營區，在22個縣市規劃出34處「天然災害收容中心」，約可收容1萬4000餘人，可供收容遭強制撤離的居民或是安置災民使用。