行政院長吳敦義今30日主持行政院莫拉克颱風災後重建推動委員會第6次委員會議，在聽取經濟部水利署報告河川砂緊急疏濬作業與中央地方協力規劃情形後表示，災後河川疏濬工作迫在眉睫，10月4日召開的治水會議必須討論出具體的作法。

吳院長指出，處理河川疏濬及水庫清淤工作應掌握三大原則，第一是中央與地方聯合，同心協力為保障2,300萬同胞的安全而努力；第二要加強橫向聯繫，相關部會包括經濟部、經建會、公共工程委員會、內政部、警政署、農委會及法務部等都要共同參與，納入警政署與法務部就是要以透明公開的作法解決問題，使不正當的力量不敢介入挑戰公權力；第三，河川疏濬要有配套措施，請經濟部思考如何在適當地點設置中繼站，以土方銀行的概念，依量計價付給清運業者合理酬勞，土方可供應國內市場需求並降低國內營造業者成本等，未來也不排除用在像高雄南星計畫的填海造地，及供應海空聯運城造地所需。

針對農委會在會中報告農田、漁塭埋沒泥沙與外來沖積土石清運及農地重劃相關事宜，吳院長表示，協助農民災後復耕重建，活化農業機能極為重要，請各級政府積極配合辦理，使農民早日恢復耕種。對流失及埋沒農田是否重劃，也請縣市政府擬定計畫後報農委會核定據以辦理，至於辦理農地重劃費用，將優先補助縣市政府。

吳院長也就漂流木處理原則，指示農委會依分工及處理進度表督促各執行單位切實依期程完成，另農田流失埋沒，重建復耕費時，為補助農民生計，請農委會依據9月29日與縣市政府及受災嚴重鄉鎮公所會商決議辦理，必須辦理重劃者，於重劃期間比照休耕，每公頃每期作補助3.4萬元，所需經費由農委會於重建特別預算編列支應。

重建委員會30日也討論內政部營建署所提，研擬民間團體興建永久屋之申請分配資格及規範案。吳院長裁示原則依規劃內容通過，並請營建署另擇期邀集受災鄉親及民間團體召開座談會，就相關細節會商以取得共識。