吳敦義14日中午首次以閣揆身份出席府院黨首長例行聚會，總統府發言人王郁琦轉述，府院黨首長表示，民眾不必特別恐慌，更不需擔心疫苗與克流感不足問題。

王郁琦說，府院黨首長會議中討論災後重建與H1N1新型流感議題，與會首長認為，立法院18日開議後，水災重建議題將是施政報告的重點項目；目前新型流感疫情還在發展中，民眾不必特別恐慌，因疫苗與克流感都準備充足，民眾不需擔心不足問題。

另外，他表示，總統馬英九17日將出席在中國國民黨中央黨部舉辦的「立法實務研討會」，與黨籍立委、行政院正副院長及國民黨一級主管討論將在立法院本會期推動的總預算案及重要法案，包括地方制度法、國土計劃法、農村再生條例、集會遊行法等修正草案。

部分弱勢團體製作的月餅滯銷，王郁琦表示，原則上總統馬英九會按去年做法認購月餅，分送社福機構或偏遠地區學童。