事實上，永久屋或多元安置方案均為申請制，在政府審定安全堪虞或劃定特定區域之4,554戶當中，有2,587戶申請永久屋，仍有1,967戶選擇留在原鄉，也就是政府劃定特定區域後，對於選擇留在災區之居民，政府並無強迫要求遷居，依然保障其人權。此外，行政院原民會仍繼續維持該地區基礎設施如道路、簡易自來水等基本生活維生機能。如有颱風（或土石流）警報發布，仍依「災害防救法」予以強制撤離，安置到安全的處所，以確保民眾的安全。

      

      「災後重建以人為本，以生活為核心，尊重多元文化特色，保障社區參與，兼顧國土保安與環境資源保育。而且，政府就災區安全堪虞土地，經與原住居者諮商取得共識，始得劃定特定區域，限制居住或限期強制遷居、遷村，並予適當安置。」，這是行政院原民會及重建會執行莫拉克重建工作秉持的精神。災害初期，原民會協同中央各相關部會不斷的與受災族人溝通、徵詢意見及協商中央政府執行特定區劃定作業及遷建過程，均依法經「與原住居者諮商取得共識」等程序辦理。

      

      原民會及重建會共同推動各項復建計畫期間，面對各種不同面向的聲音，原民會始終以同理心採取公平正義的態度面對問題、解決問題，並以最真誠的心積極辦理重建工作。遷建期間，原民會傾聽民意不定期下鄉與族人進行面對面溝通，從目前各災區復建及安置的情況看來，原來的隔閡與衝突正因復建計畫周延落實，不但逐漸消除，轉換攜手合作，各項建設也有具體顯著成效。