在經濟委員會，廖國棟質詢水利署署長是否有把預算用完，把該做的水利工程做好，再針對水利署整治河川與地方水患的預算，強烈要監督對症下藥，尤其廖國棟說莫拉克的原鄉重建的特別預算和水利署水患治理預算不可以重疊，尤其是太麻里溪的整治，應該有針對性的執行原鄉的災後重建，水利署表示，莫拉克特別預算跟國家水患治理預算在東部的重建區域是有共同涵蓋的區域，但是預算是分開編列的，絕對沒有重疊的問題。

國家的河川治理的特別條例編列了8年一共1160億元的預算，但是簡東明質疑這針對的都是區域性的排水問題，但是上游部分的河川整治做得並不完善，執行動作也太緩慢，導致在台東嘉蘭部落當莫拉克颱風這種強颱橫掃的時候就沖走了50幾棟房屋，河川氾濫問題造成超乎預期的連帶破壞力，這都是因為當初政府在整治上游的時候沒有積極的作為，簡東明說台東嘉蘭地區的民眾應該得以額外申請國家賠償，整治河川不能依賴地方公務預算，河川治理特別條例的整治預算應該要積極介入來使用。

水利署長則是針對河川整治不力的部分表示會積極進行檢討，無論是特別條例或者是地方的公務預算，水利署會協同地方政府把河川的上中下游的整治積極加強，讓民眾不要受到加倍的傷害。