8月間莫拉克颱風襲台，造成濁水溪水系主支流均有災情傳出，豪雨洪水將上游山溝野溪淤積土石帶至河道中，造成濁水溪、清水溪及陳有蘭溪部分河段河道土石大量淤積，為疏導水流、增加通洪斷面，及避免汛期該河段淤積土石遭洪水沖刷淤積於下游河段，影響橋樑及河防設施安全，淤積土石需適時疏濬、清除，以維護河防安全。水利署第四河川局表示，經該局災後清查，需要再辦理疏濬的土石方量約1,400萬立方公尺，為歷年疏濬量的3倍之多。

該局表示，疏濬計畫分成15案(其中南投縣政府協助辦理4案，土石方量約510萬立方公尺)分別辦理公開招標，並配合河床運輸道路之施作期程，於9月2日起陸續開始出料，至10月27日為止，已出料33萬立方公尺，預計於明(99)年6月底汛期前完成1,215萬立方公尺，並於明年底完成預估的疏濬土方量。