行政院長吳敦義今(15)日在行政院會聽取經濟部及行政院農業委員會所提之「99年防汛及土石流防災整備情形」報告案後表示，防汛期即將到來，大家必須嚴肅以對。他說，防汛首重減災及避災，最後才是救災，內政部、經濟部、農委會等相關機關及各直轄市、縣（市）政府應全力趕辦易淹水地區的治水工程，對於汛期前無法完工的復建工程或仍有防汛缺口的河段，包括林邊溪及太麻里溪等，務必確實做好各項應變措施，並落實演練，讓可能發生淹水的機率降至最低。

吳院長指出，莫拉克颱風災後，山區淤積大量鬆軟土石，極易被雨水沖刷致發生重大災害。因土石流災害多發生在交通較為不便的山區，所以第一線防救災工作的地方政府，執行能力尤其重要，各部會應積極督導、主動協助地方政府，加速完成各項防災整備工作，除落實演練、加強宣導外，同時要追蹤各項疏散避難計畫、標準作業程序、通信聯絡及物資儲備的執行情形。

吳院長亦指示交通部督促各道路主管機關，依相關作業程序事前檢視各橋梁安全狀況，除加緊趕辦未完成復建的跨河橋梁工程，也要妥善規劃危橋封橋的管制措施，並加強演練。另颱風豪雨期間，石門水庫及高屏溪攔河堰的原水濁度可能飆高，經濟部要特別加強應變措施，以避免影響桃園及大高雄地區正常供水。