行政院長吳敦義18日報告施政方針時指出，因應台北縣等 4個直轄市改制案，行政院將加速完備配套法制，務在2010年12月25日如期完成改制。

吳敦義接任行政院長後，首次赴立法院報告施政方針，在民進黨立法院黨團杯葛逾1小時後，上台報告。

有關H1N1新型流感疫情防疫，吳敦義表示，政府已採購國內外H1N1新型流感疫苗合計1500萬劑，並儲備充足克流感等抗病毒藥物與防疫物資。政府也將積極協調國內外疫苗廠如期交貨，確保品質安全無虞，讓國人安心使用。

吳敦義指出，為強化政府治理能力與行政效能，提供人民更優質行政服務，將持續推動行政院組織法等政府組織改造法案立法，並因應台北縣等 4個直轄市改制案，加速完備配套法制，務在明年12月25日如期完成改制。

他說，為使選務獨立機關順利成立運作，將儘速提出新任委員名單，送請立法院行使同意權。

吳敦義表示，將全力整合各界意見，推動集會遊行法早日完成修法；為做好肅貪防弊工作，將積極健全中央廉政委員會運作，並貫徹執行貪污治罪條例、公職人員財產申報法等陽光法律，嚴懲不法、維護官箴，重建人民對政府信賴。

吳敦義指出，行動團隊要落實 5大施政重點，包括「加速重建工作，強化治山防洪」、「完備疫情防治，確保國人健康」、「全力振興經濟，積極促進就業」、「兩岸互利共榮，務實拓展外交」，及「全面興利除弊，鞏固社會安全」。

在兩岸互利共榮方面，吳敦義說，將秉持「以台灣為主，對人民有利」基本原則，穩健、循序地推展兩岸關係，逐步完成兩岸金融監理合作備忘錄（MOU）， 及經濟合作架構協議（ECFA）簽署。

吳敦義表示，未來任何兩岸重要協議簽署，都必須在「國家需要」、「民意支持」及「國會監督」原則下進行。以ECFA為例，未來兩岸協商過程中，將尋求台灣利益極大化、衝擊極小化基本立場，絕不退讓，也將透過相關鼓勵與輔導措施，因勢利導，協助相關產業轉型升級，有效降低對特定產業不利影響。