行政院莫拉克颱風災後重建推動委員會南部辦公室28日表示，為協助屏東縣林邊、佳冬鄉災後早日恢復正常生活，已由環保署派員全天候清理災後廢棄物及淤泥，並調度53輛清溝車，常駐當地協助軍方執行側溝阻塞路段疏濬。

對於積水嚴重的林邊鄉光林、林邊、中林三村，雖已大致清理完畢，但南部辦公室也建議，只要仍有積水未退、淤泥未清、缺水、廁所不通或廚房水管不通等情形之一者，即不適合在當地過夜。政府相關部會將提供符合以上條件的民眾各種協助，包括災民租屋補助（內政部）、天然災害臨工計畫（勞委會）及交通接送（交通部）等。衛生署將派人在28至29日兩天完成居民住戶訪視判定與意願調查，協助居民儘快找到暫時居所，待環境改善後再返回現居地。

南部辦公室指出，環保署並已在國道3號（第二高速公路）林邊交流道附近私有空地開設廢棄物轉運站，全天候營運管理，8月19日至26日間，已執行35噸以上大型車清運940車次，約轉運14,105公噸含淤泥之混合廢棄物。此外，崁頂焚化廠、枋寮區域衛生掩埋場亦協助處理災後混合廢棄物、農牧廢棄物，共計98,434公噸。

南部辦公室進一步指出，在積水消退及淤泥清理地區，環保署已協同衛生署進行戶內外同步環境消毒，於尚未完成清理區域則定期戶外消毒。環保署也於林邊、佳冬二鄉佈置101座流動廁所，並視需要隨時增加。