莫拉克颱風風強雨驟，中南部地區二、三天即降下超過2,000公厘的累積雨量，造成大規模淹水災情，災害之大為台灣50年來僅見。水利署表示，依據行政院「莫拉克災後重建事項一覽表」，民眾如有遭受水災每戶可由特別預算發放救助金最高2萬元，救助標準以淹水超過50公分為救助對象，並授權由縣市政府從寬認定。

水利署表示，因特別預算核定尚須時日，為了使受災災民能儘速收到救助金， 8月20日已報准奉行政院同意由經濟部籌措財源先行墊支，同日並以公函及電話聯繫縣市政府檢附收據向經濟部水利署請款即可，該署可立即撥入相關縣市政府救災專戶發放救助金給受災戶，為爭取時效，同時並請縣市政府由自有財源先行墊發，據統計縣市政府截至目前已發放救助金1億2仟餘萬元。

水利署表示，此次風災造成大規模淹水，經濟部部長已降感同身受，特指示經濟部所屬主動聯繫各縣市政府儘速發放救助金，讓受災民眾申請後可於最短時間內取得救助金，以利於清理家園，迅速恢復正常生活。

水利署表示，受災民眾符合救助標準仍尚未提出申請者，可速向轄屬縣市政府或村里辦公室提出申請，如有問題，亦可撥莫拉克颱風災後服務專線0800-212239詢問。