行政院長吳敦義11日出席全國治水會議開幕式致詞時，呼籲同胞愛惜保育國土，維護國人生命財產，共同了解台灣面對全球氣候變遷的險峻局面，當前唯有從國土保育、復育做起，行政院已經通過國土計劃法，將送立法院審議。院長盼望社會各界人士，共同為防洪治水、興利除弊的大計多所貢獻。

吳院長表示，當前我國遭受全球暖化與氣候變遷，這次莫拉克颱風造成重傷之後，行政院相關部會分別到各縣市去，看到很多河床上淤積的砂石，甚至已接觸橋面，有些已對堤防造成嚴重傷害。回顧過去，台灣由於地理環境，中央山脈從北到南，無論是流向台灣海峽或太平洋的河流，都極為短促，因此在豐水期常造成水災，枯水期又造成許多地方缺水的困境。院長說，砂石之利可以填海造陸，可以做營建工程建材，但若讓砂石淤積在水庫裡，減損水庫功能，縮短水庫壽命，若淤積在河川，會造成對道路、橋樑嚴重衝擊，甚至減少防洪排水功能，一旦雨季來臨，就造成重大水災。

吳院長指出，台灣雖歷經多次改革，但一條河川的上游有林務局、中游有水保局、下游分屬縣管、中央管，乃至於社區排水屬營建署管轄，還有野溪。有些市區排水系統做的不夠，有些缺乏長年維持暢通，往往一雨成災，不下雨則變成旱災，在此情形下，必需集合各方的智慧與經驗，共同尋求妥善有效的治水政策，據以執行，並統合各方力量，形成有效率、能貫徹的方法解決台灣的水患，發揮水利功能。